Apps i software
En aquesta secció s'inclouen tots alguns dels resultats, com ara eines informàtiques, llibreries, aplicacions web, etc., que es deriven dels projectes de recerca en els quals estic involucrades.
L'Encuesta Sanitaria y Social (ESSA) té com a objectiu determinar la magnitud, les característiques i l'evolució de l'impacte de la COVID-19 en la salut general, així com els determinants socioeconòmics, psicosocials, conductuals, ocupacionals, ambientals i clínics tant generals com específics.
Atles dels Determinants Socials en Salut (Cabrera A, Saez M, Campoy F, Perafita X, Mateo I, Barceló MA, Daponte A). Aplicació web Shiny, 22 de juliol, 2022
L'Atles dels Determinants Socials de la Salut a Espanya recopila i mostra el conjunt d'indicadors dels “Determinants Socials de la Salut”. Els Determinants Socials de la Salut (DSS) són les circumstàncies en què les persones neixen, creixen, viuen, treballen i envelleixen, en definitiva, són les condicions en què transcorre la vida quotidiana, segons l'OMS. Les condicions millors o pitjors d'aquests determinants són les que defineixen el nivell de salut de la població; i els canvis en aquests DSS, resultat dels canvis econòmics i socials que ocorren al nostre país, així com de les polítiques que desenvolupen tant les institucions públiques com el sector privat en resposta a aquests canvis, causen alhora canvis en la salut de la població al llarg del temps. Així mateix, són les diferències en les condicions dels DSS les que expliquen majoritàriament les desigualtats en la salut entre les comunitats autònomes espanyoles.
Els indicadors es mostren visualment utilitzant diferents tipus de gràfics i mapes, de manera que es pugui observar l'evolució temporal i les diferències entre les diferents comunitats autònomes, així com la bretxa de gènere. La plataforma permet seleccionar els indicadors, els períodes temporals, les CCAA i el sexe, per produir els gràfics o els mapes, possibilitant també la màxima personalització per part de l'usuari. Finalment permet també la descàrrega dels gràfics produïts i de les dades seleccionades. L'Atlas, el directori d'indicadors i les dades es poden consultar i descarregar en la web. Tant el directori d'indicadors com les dades es revisen i s'actualitzen periòdicament.
Aquest Atles es desenvolupa en el marc del Programa de recerca sobre els Determinants Socials de la Salut del CIBER d'Epidemiologia i Salut Pública (CIBERESP). En la seva elaboració han participat professionals de diferents institucions. El grup de recerca sobre “Determinants socials, medi ambient, ciutadania i salut” de l'Escola Andalusa de Salut Pública, i el “Grup de Recerca en Estadística, Econometria i Salut (GRECS)” de la Universitat de Girona, han seleccionat, i tractat estadísticament els indicadors que conformen aquest Atles, així com realitzat el disseny i execució dels seus gràfics i mapes.
PandemonCAT: Monitoring the Pandemic in Catalonia (Giménez-Adsuar G, Chaudhuri Som, Barceló MA, Saez M). Aplicació web Shiny, 29 d'octubre de 2021
L'objectiu d'aquest projecte és oferir una visió completa de la pandèmia de la COVID-19 a Catalunya, Espanya.
En aquesta aplicació trobareu una llista completa de totes les variables clau respecte a la malaltia: nous casos, hospitalitzacions, UCI i defuncions. També s'ha representat el flux de vacunació (tant la primera com la segona dosi) per a diferents grups d'edat de la població en zones de salut individuals de la comunitat.
L'aplicació proporciona informació sobre altres variables socioeconòmiques i ambientals, com ara variables meteorològiques i de contaminació de l'aire, població per grups d'edat, taxa d'atur, ingressos per càpita i altres en una interfície geoespacial. L'aplicació també ofereix una interfície interactiva per visualitzar la mobilitat pública abans, durant i després de les fases de confinament a la comunitat. Es demostra la visualització d'aquestes variables que podrien influir en la dinàmica espai-temporal de la pandèmia. Creiem que la incorporació d'aquestes noves dimensions, que és la innovació clau del nostre projecte, millorarà la comprensió actual de la propagació i l'impacte de la COVID-19. Aquest projecte complet ofereix una aplicació web interactiva que permet el seguiment de la pandèmia COVID-19 a Catalunya (PandemonCAT).
PandemonCAT-Vaccination: Monitoring the Pandemic in Catalonia-Vaccination (Giménez-Adsuar G, Chaudhuri Som, Barceló MA, Saez M). Aplicació web Shiny, 15 de juny de 2021
Aquesta aplicació forma part del projecte ‘Monitoring the Pandemic in Catalonia’ (PandemonCAT).
L’objectiu del projecte PandemonCAT és proporcionar una aplicació web que permeti el seguiment de la pandèmia COVID-19 a Catalunya. Els seus resultats inclouen, a més de la vacunació, els resultats de les proves diagnòstiques, la transmissió (nombre reproductiu), l’hospitalització, els ingressos a les UCI i el nombre de morts. També es proporciona la visualització d’aquelles variables que podrien influir en la dinàmica espai-temporal de la pandèmia. Així, es mostren en una interfície interactiva, les variables ambientals (contaminants atmosfèrics i variables meteorològiques), les variables socioeconòmiques, els punts d’interès on hi pot haver un risc més gran i les dades de mobilitat pública.
smartables: Automatically generate ready-to-publish descriptive tables and Generate summary tables from GLM, Cox Regression and INLA model outputs (Giménez-Adsuar G, Saez M, Barceló MA). CRAN Package, 7 d'abril de 2021
Un paquet de R que conté dues funcions: create_table() i modeltable().
La primera d’elles carrega un data frame i altres variables alfanumèriques per indicar a la funció quines variables no són d’interès en el resum, així com aquelles que generaran les taules estratificades. Aquesta funció genera dues data frames: una per al resum general i altra per a la taula estratificada.
La segona funció carrega el resultat d’un GLM, una Regressió de Cox o un model INLA, i retorna una taula resultat llista per a publicar.
formals: Formulari per a la recollida de dades sobre pacients amb malaltia de motoneurona (Barceló MA, Franquet A, Povedano M). Registre de la Propietat Intelectual (programari de recerca). Número Sol·licitud: A001-7065/2019. Data Sol·licitud: 13 de novembre de 2019
Diseny d'un formulari confeccionat per a la recollida de dades en forma longitudinal per a un model comú de dades en pacients amb malaltia de motoneurona.
eventr: Create Event Based Data Architectures (Franquet A, Barceló MA, Saez M, Plaja P). CRAN Package, 26 de maig de 2020
Un paquet de R que té com a objectiu facilitar la creació i l'anàlisi d'arquitectures de dades basades en esdeveniments (EDA). Aquesta arquitectura és un model abstracte de la informació que descriu un conjunt de dades i com s'organitza aquesta. Una EDA fa ús d'esdeveniments per desencadenar un conjunt d'accions: transportar la informació necessària per dur a terme una acció ('event'); processar la informació de l'esdeveniment per executar alguna tasca ('handler'); avaluar els esdeveniments i decidir quin controlador (o handler) utilitzar en funció de l'tipus d'esdeveniment ('dispatcher').